Sci Adv:没有事实支持哺乳动物中细菌表观遗传标记的存在

2021-10-12 11:23:26 来源:
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导言:在现代之过去,有机体就开始了在不改变大肠杆菌蛋白质DNA民间组织顺序的过去提从前使其DNA体现不同的机制,而这就是通过给DNA亚基上添加生物化学上标来实现的。DNA氨基化是哺乳动一物的关键表观表型机制,其中的5-氨基胞嘧啶(5mc)是最类似的DNA省略之一。6mdA是大肠杆菌上限性省略系统的基本组成成分,现阶段在哺乳动一物中的不够据信的上限性省略系统。先过去有不少研究工作媒体报道,6mdA也实际上于哺乳动一物中的,但并无证据支持。

近日,在《科学进展》上的一项研究工作中的,瑞典林雪平的学校的研究工作工作人员不太可能,哺乳动一物蛋白质中的实际上大肠杆菌表观表型上标很可能被污染了,并且仍未充足的证据来断言哺乳动一物中的实际上这种省略。

N6-氨基腺嘌呤(6mdA)是大肠杆菌中的相当多的DNA省略,但最近在哺乳动一物DNA中的也赢取了连续性。然而,研究工作工作人员说,即使对来自相近哺乳动一物蛋白质类型的DNA进行的6mdA谱图和同位素测量研究工作也不一致。

为了有利于阐明6mdA在哺乳动一物谱系规格中的的作用,研究工作工作人员并用了体外将人类文明幼稚T辅助(NTH)蛋白质发挥作用为TH蛋白质亚群的能力。但是,与先过去的研究工作同样,他们见到TH发挥作用过程中的6mdA的同位素仍未全局变动,并且辨别到发挥作用的T蛋白质中的的6mdA高水平与仍未氨基化的全原核生一物增为DNA相近,这不太可能6mdA并仍未以可检测的高水平实际上人类文明T蛋白质中的。

他们还比对了从六个人类文明蛋白质系中的分离出的DNA中的的6mdA,并鉴定出两个带有高于背景阻尼高水平的6mdA高水平的蛋白质系。出乎意料的是,两种单独的293T蛋白质系培养一物带有不同的6mdA高水平,这不太可能研究工作工作人员辨别到的6mdA波形并非蛋白质类型本身固有的。不太可能,当他们有利于看时,他们见到两条6mdA高水平下降时的蛋白质系被芽孢同属污染,芽孢同属一种类似的大肠杆菌蛋白质培养一物中的矿物质6mdA的污染一物。当他们用芽孢特异性抗生素Plasmocin处理蛋白质系时,6mdA波形减小为WGA阳性对照。

“我们注意到通过这些新科技检测到的6mdA'波形'只是阻尼。但是,由于一些精细的新科技问题,几种步骤中的的背景阻尼不是随机的,而是真实波形。”高级作者Colm Nestor(科尔迈·内斯特)在一份声明中的说道。

研究工作工作人员比对了以过去通过DNA免疫沉淀基因组、核磁共振和单分子结构实时基因组在哺乳动一物蛋白质中的定位或检测6mdA的努力。人们见到每种步骤都有局限或缺失,使表观表型上标的假阳性见到率高,却是不太可能林雪平研究工作工作人员认为不实际上这种物理现象的证据。

这组作者说:“我们断言,RNA和大肠杆菌污染、免疫交叉反应性和其他新科技上限的结合已加剧6mdA在哺乳动一物DNA中的的反复错误识别。随着DNA和RNA省略家系的随之增长速度,以及以过去仍未知省略的侧重越来越相像,即使用到多种互补步骤,我们也强调了错误见到的可能性。我们建议用到省略和仍未省略的原核生一物DNA规格作为今后对绿宝石DNA省略的研究工作的最低要求,以及在用到过去更全面地实验者免疫特异性。”

内斯特补充说道,研究工作工作人员在研究工作比较相像的物理现象时必须比较小心,选取用到哪种步骤,并考虑他们是不是真正在衡量实际上的事一物。他说道:“现今我们可以毫无疑问地说道哺乳动一物中的不实际上6mdA。关于6mdA,如果研究工作工作人员暂时中止研究工作根本不实际上的样子,则可以耗费大量时间和金钱,并且可能会了很多令人失望的事情。”

原始出处:

Karolos Douvlataniotis, Maike Bensberg, Antonio Lentini, et.al. No evidence for DNA N6-methyladenine in mammals. Science Advances 18 Mar 2020: Vol. 6, no. 12, eaay3335

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